Con 28 años de labor institucional, Profonanpe se ha consolidado como el fondo ambiental privado más importante del Perú. Desde su fundación se ha caracterizado por ser una institución especializada en crear, desarrollar e implementar procesos innovadores en la gestión administrativa y de fondos, y la gestión participativa e involucramiento de la empresa privada. Los inicios de Profonanpe se remontan a la obtención de un capital semilla que fue orientado tanto al soporte institucional, como al financiamiento de actividades de conservación en áreas naturales protegidas. Este diseño ha servido también para que el gobierno y sus aliados internacionales comprometan recursos a través de la negociación de operaciones de canje de deuda por naturaleza. Asimismo, es la primera organización de este tipo en contar con un diseño adaptado a la administración de fondos fiduciarios.